PickR

PickR

選擇靜電多樣化的單體生成高質量、獲取更好的知識產權

在你的R基團中尋找隱藏的關系,以提高組合庫的多樣性、提高的篩選命中率。

與其他方法不同,PickR使用3D靜電和形狀性質來描述單體之間的分子相似性,從而提供更有意義的化學空間來設計苗頭化合物發現庫。 PickR是與我們的客戶合作開發的,并在藥物化學家和合成化學家中建立了良好的聲譽,它使數據庫的化學多樣性最大化。

計算化學家與化學信息科研人員用PickR可以:

  • 根據場和形狀的3D多樣性對試劑庫中的化合物進行排序、挑選。
  • 對每一個試劑進行兩兩比對、計算靜電與形狀相似性
  • 生成相似性矩陣
  • 易于用更多的試劑對現有的庫進行擴增
  • 用外部工具自動或手動聚類
  • 以2D或3D方式觀察聚類結果

特性

  • 靈活的命令行界面
  • 支持本地或集群計算
  • 支持集群的隊列管理系統
  • 自動多步驟計算
  • 通過XedEx構象分析工具對2D的SDF或SMILES格式試劑數據庫處理
  • 支持3D構象

PickR是一款命令行應用,聯合使用了Cresset與RDKit技術。

PickR 3D and 2D pictures of all side chains in the phenylalanine cluster 3D representations of all 20 clusters

2D_MACCS_vs 3D similarity for 200 boronic acids

3D and 2D pictures of all side chains in the phenylalanine cluster

3D representations of all 20 clusters generated from 200 boronic acids aligned to each other using the B-C bond of the boronic acids

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